于当下这个经济管理范畴当中，绩效评价审计有着不可或缺极为关键显著重要的作用。它不但能够去衡量组织运行的效率以及效果，还能够面向决策给予具有强大有力作用的依据。然而呢，绩效评价审计可不是稳稳当当顺顺利利毫无阻碍的，这种审计里存在着好多好多的难点，与此同时还有需要着重重点予以关注留意的方面。
绩效评价审计的难点指标体系构建困难
绩效评价审计得要有一套科学且合理的指标体系，以此来衡量被审计对象的绩效。然而，不同行业以及不同组织，它们的业务特点和目标存在着巨大差异，所以很难去制定出通用的指标体系。就拿制造业和服务业来说，制造业更为注重生产效率、产品质量这类指标，而服务业则是更关注客户满意度、服务响应时间等方面。另外，即便在同一行业当中，不同企业的战略重点以及管理模式也并非完全一样，这进一步加大了指标体系构建的难度。比如，有一家把创新当作导向的科技企业，它也许会把研发投入占据的比例、专利的数量等当成关键指标，然而另一家将成本控制作为核心的企业，就会更加留意成本降低的比率、资源利用的效率等指标。
数据收集与质量保证
要得出结论，绩效评价审计仰赖大量数据，然而，数据收集进程常常遭遇诸多难题，一方面，数据的源头既广泛又分散，兴许牵涉多个部门以及系统，整合这些数据得耗费大量时间及精力，另一方面，数据质量没法确保，部分数据可能存在不准确、不完整或者过时的状况，这会直接影响到审计结果的可靠性，比如说，在一些企业里，因数据录入不规范或者系统故障，致使财务数据跟实际业务情形不一致，审计人员需耗费大量时间去核查并修正这些数据。
主观因素影响较大
开展绩效评价审计时，主观因素无可避免地会给审计结果带去影响，审计人员的专业判断、经验以及个人偏好等，都会于一定程度上对绩效评价造成影响，比如说，针对一些像企业文化、团队协作等难以量化的指标，不同的审计人员有可能给出不一样的评价，另外，被审计对象的主观态度也会对审计工作的推进产生影响，要是被审计对象不予以配合或者提供虚假信息，会加大审计的难度以及风险。
审计成本与效益平衡
绩效评价审计得投入一定量的人力。还要投入物力以及时间成本。在实际工作当中。怎样在确保审计质量的前提之内。去合理控制审计成本。以实现成本跟效益的平衡这是一道难题。要是审计范围过大。同时程序过于复杂的话。就会致使审计成本过高。然而要是审计范围过小。并且程序过于简化的话。又兴许没办法全面精准地评价绩效。进而影响审计的效果 。举例来说，针对某些小型企业，鉴于资源存在限制，或许没办法承受大规模的绩效评价审计项目，然而又有通过审计去发觉问题以及改进管理的需求，如此一来就要求审计人员于成本跟效益之间寻觅到一个恰当的平衡点。
绩效评价审计的重点目标设定的合理性
绩效评价审计，首先得关注被审计对象目标设定情形，看其是否合理。目标乃是组织开展各项活动的导向，合理的目标应当拥有明确性，具备可衡量性，拥有可实现性，具备相关性以及有时限性。审计人员要去评估目标是否跟组织的战略规划相契合，是否符合实际状况和市场环境。比如说，要是一家企业所设定的销售目标过高，大大超出了市场需求以及企业的实际销售能力，那么这个目标便是不合理的，极有可能致使企业资源出现浪费，并且会让经营风险有所增加。
资源配置的有效性
组织达成目标所依赖之事为资源，绩效评价审计着重审察资源配置有无成效其中涵盖人力资源、物力资源、财力资源等的分配运用状况审计人员要评定资源有无被恰当地分部于各个业务环节与项目里，其有无资源闲置或者浪费现象举个例子，于众多企业之中，或许存在人员多余、设备没被使用等情形致使资源运用效率不高经由审计，能够探查出这类问题并给出改进提议，优化资源编排，提升组织的绩效 。
业务流程的优化
通向组织实现目标的途径是业务流程，绩效评价审计应关注业务流程有无优化，高效的业务流程可提高工作效率、降低成本以及提升质量，审计人员务必审查业务流程有无繁琐、重复、低效的环节，有无内部控制漏洞，比如，在一些企业的采购流程里，或许存在审批环节过多、采购周期过长等情况，这会对企业的采购效率与成本产生影响，借由审计，能提出优化业务流程的建议，像简化审批环节、采用信息化手段等，以此提高业务流程的效率和效益。
